堆肥工艺用于餐厨垃圾处理能有效地实现餐时垃圾的无害化、减量化和资源化、成量化和无害化。堆肥场地的重复使用减少了垃圾域理所产生的征地问题。能有效地使立坡中的有机物稳定下来，降低有害物质的生成，减少对自然环境的污染，并得到堆肥产品，存在一定经济收益。

目前，已建成的垃圾堆肥厂实际的运行状况不是太好，只有北京、广西、上海、四川的垃圾堆肥厂在运行。一些堆肥处理厂运行成本过高， 堆肥质量很低，产品销路不畅而陷于半停产或难痪状态。归结起来，主要有以下几个原因。
1.我国城市垃圾未实行分类收集我国城市混合收集的垃圾杂质含量高， 为保证堆肥的产品质最必须采用复杂的分离过程，导致产品成本过商，如果没有政府的补贴很难正常运行。若不进行分离筛选或分离筛选不彻底就会使垃圾堆肥存在一系列的问题。

由于垃圾的混合收集，堆肥产品中含有玻璃、金属等大量无机物成分，这将直接影响垃圾堆肥的产品质量。此外由于垃圾堆肥中的灰土所占比例较高，一些粗砂和砾石级别的颗粒含量较高，大量使用有可能引起土壤渣化和砾化。虽然垃圾堆肥中有效N、P、K的含量明显高于土壤，大约是普通土壤的10倍左右，有机质含量约为普通土壤的5倍，但其N、P、K的总含量小于3%，尤其是K含量甚至低于土壤中的全K含量，无法与无机化肥相比。

欧美一些国家堆肥技术发展和应用较快，主要因为垃圾源头分类效果好。堆肥厂的原料是有机垃圾，如庭院垃圾和园林垃圾(修剪树木和草坪产生的绿色垃圾)、菜市场腐烂蔬菜水果、污水污泥等，这些垃圾完全可以用来堆肥处理，所以堆肥产率高，堆肥产品感官效果好，有机质及营养成分含量较高，形成了一种良性循环。

2.垃圾堆肥过程中产生污染由于垃圾未实行分类， 由电池等引起的重金属以及有毒有害物质的混人将严重影响堆肥产品质量。而在堆肥过程中产生的恶奥严重影响周边环境。此外垃圾堆肥处理是针对垃圾中能被微生物分解的易腐有机物的处理，而不是全部垃圾的最终处理，仍有30%以上的堆肥残余物需要另行处置。

3.垃圾堆肥产品销路不畅一般堆肥产品只能们作为土壤改良剂或腐殖土，销路取决于堆肥场所在地区土壤条件的适宜性。在黏性土壤地区，特别是南方的红黄小，质量较差的堆肥产品通常只能就近销售。而利用其制造的复合肥，由于其成本过高也在与一般化肥和复合肥的竞争中不占优势。此外，堆肥产品销售有季节性，而垃圾堆肥处理则是连续的，生产销售之间存在的这种“时间差”，会增加生产成本。